مدرسه علمیه حضرت خدیجه(س) به منظور رشد و اعتلای علمی – پژوهشی طلاب و دانش پژوهان، آشنایی با مسائل روز، ارتقاء توان تبلیغ و پاسخگویی علمی به مسائل و شبهات دینی وبا استفاده از کادری مجرب از اساتید حوزه ودانشگاه, اقدامات مهمی را طراحی و اجرا نموده که به اهم آنها اشاره می شود:
– هدایت، پیگیری، تدوین و تنظیم مقالات و پایان نامه‏های طلاب
– تشکیل بانک موضوعات به روز جهت دستیابی سریعتر طلاب به نیازمندیهای علمی پژوهشی
– ایجاد هسته‏های پژوهشی با موضوعات فلسفه برای کودکان، نهج‏البلاغه و …
– برگزاری کارگاههای پژوهشی با موضوعات مختلفی از جمله: مدیریت زمان، روش تحقیق در نهج‏البلاغه، مقاله نویسی ، آشنایی با نرم افزارهای پژوهشی و …
– برگزاری کلاسهای هفتگی نهج ‏البلاغه به صورت عمومی با حضور اساتید مجرب از جمله: آیت الله دین پرور، جناب آقای دکتر دلشاد تهرانی، خانم احمدی