دوفصلنامه «شبهه پژوهی مطالعات قرآنی» با صاحب امتیازی دانشگاه علوم و معارف قرآن کریم قم می باشد، کلان محورهای فراخوان مقاله نشریه «شبهه پژوهی مطالعات قرآنی» به شرح ذیل می باشد: 1ـ بررسی شبهات مربوط به سیره نبی اکرم (ص)؛ 2ـ بررسی شبهات اعتقادی در زمینه توحید، معاد بررسی شبهات مربوط به عصمت انبیاء؛ 3ـ بررسی شبهات مربوط به مصادر قرآن، وحی و ... ؛ 4ـ بررسی شبهات و دیدگاههای مستشرقین درباره مباحث قرآنی؛ 5ـ بررسی شبهات تاریخی قرآن؛ 6ـ بررسی شبهات فقهی قرآن؛ 7ـ بررسی شبهات مطرح شده در دایره المعارف لیدن و دایره المعارف اسلام.محتوی سایت : مقاله ، مطالعات قرآنی ، شبهه پژوهی ، دو فصلنامه .