موزه آستان مقدس حضرت شاهچراغ (ع) همزمان با عید مبعث و به تاریخ 30 آبان 1344 هجری شمسی ، مقارن با 27 رجب 1358 هجری قمری افتتاح گردید.در سالهای نخستین تاسیس موزه روزهای پنج شنبه را به بازدید علاقه مندان اختصاص داده بودند.اولین ساختمان موزه متشکل از فضای کوچکی بود که در مکان فعلی ورودی خواهران به حرم مطهر برپا گردید.در سالهای پس از انقلاب اسلامی و اهتمام بر حفظ و صیانت از آثار ارزشمند تاریخی ، فرهنگی مسئولین وقت را بر آن داشت تا در سال 1363 ه.ش با تبدیل چند اتاق به محوطه سالن مانند در ضلع شمالی صحن شریف برخی از اشیاء موزه به نمایش گذاشته شود.