تعتبر جامعة المصطفى مركزاً علمياً إسلامياً وحوزوياً عالمياً، ولقد تزيّنت هذه الجامعة بالاسم المبارك لرسول الرحمة، خاتم الأنبياء، محمد المصطفى (ص)، وهي تهدف إلى تلبية حاجة المتلهفين لزلال المعارف الإلهية، وإيجاد حركة جديدة في مجال تطوير النظريات الإسلامية.أهداف هذا المركز العلمي عبارة عن:1) تأهيل المجتهدين والباحثين والمدرسين والمبلغين وعلماء الإسلام المتقين الملتزمين.2) تبيين وتعميق الأفكار القرآنية والإسلامية، وتطوير النظريات الإسلامية والمعارف الإلهية والإنسانية.